馬來西亞森林研究所最近更新了馬來西亞紅樹林的數據。沙巴州有大約馬來西亞紅樹林總面積的61%，超過63萬公頃。沙撈越紅樹林占總面積的22%，余下紅樹林位于馬來西亞半島。自1990年以來，共約20,000公頃，大概是總面積3%的紅樹林消失了，尤其是在室外永久性森林保護區或者國有土地內的。紅樹林覆蓋面積減少的主要原因是轉為其他土地用途，其他因素如海岸侵蝕和污染也影響了紅樹林生長。